感染症内科では院内の感染症の診断・治療および感染対策について担当しています。抗菌薬適正使用支援チーム（Antimicrobial stewardship team, AST）として，院内の全診療科からの感染症の診断や治療に関するコンサルテーションを受けています。また，血液培養陽性例や耐性菌分離例，抗酸菌陽性例などでは必要に応じて積極的診療支援・介入も行なっています。同時に感染対策チーム（Infection control team, ICT）として，院内感染対策を担当しています。さらに，県や保健所，他の医療機関と協力・連携しながら，地域での感染対策を進めています。
　当院は第一種感染症指定医療機関であり，新型コロナウイルス感染症（COVID-19）や結核などの種々の感染症への対応において中核的な役割を担っています。次の新興・再興感染症の発生・流行に備えて，受け入れ体制の準備も進めています。また，エイズ治療中核拠点病院として，HIV感染症・エイズ診療を行なっています。
　さらに，国内外の研究室や医療機関と共同して感染症に関する臨床研究を行なっており，その成果をLancet Infectious Diseases 誌などに発表しています。

• ASTコンサルテーション：院内各診療科の感染症治療難渋例，血液培養陽性例，耐性菌分離例，抗酸菌陽性例
• 専門性の高い感染症（感染症法に基づく届出感染症など）：HIV感染症・エイズ，結核，非結核性抗酸菌症，梅毒，輸入感染症（マラリア，デング熱など）
• 地域で流行する感染症への対応：感染症診療，感染対策